用棉签掏耳朵疼痛要根据患者的具体病情来进行决定。建议患者应该及时的去医院的耳鼻喉科进行就诊，查看耳朵是否存在中耳炎的情况，如果患有炎症需要在医生的指导建议下合理的进行治疗。